26.10.2016 - 12:38
BARCELONA, 26 (EUROPA PRESS)
Investigadors del grup de Genòmica Biomèdica de la Universitat Pompeu Fabra (UPF) i de l’Institut Hospital del Mar d’Investigacions Mèdica (Imim) han creat una pàgina web oberta a la comunitat científica per dissenyar panells de seqüenciació per a càncer.
L’eina, anomenada ‘OncoPad’ i publicada en la ‘Genome Medicine’, busca alteracions de l’ADN del tumor del pacient –mutacions–, que puguin tenir un valor diagnòstic, pronòstic o terapèutic per a la malaltia, ha informat el centre aquest dimecres en un comunicat.
Per poder identificar aquestes mutacions s’ha de seqüenciar l’ADN del tumor, ja sigui amb tot el seu genoma, el seu exoma –la part funcional del genoma– o només certs gens o regions gèniques, que s’inclouen en panells.
La seqüenciació mitjançant panells presenta avantatges respecte a la seqüenciació de tot el genoma o exoma, i a més de posseir un millor coeficient de cost/benefici, els papers detecten menys falsos positius gràcies a la seva major sensibilitat.
Mitjançant una interfície senzilla i intuïtiva, ‘OncoPad’ identifica quins gens o regions són els millors candidats per al disseny d’un paper específic, basant-se en l’associació coneguda dels gens a mecanismes de desenvolupament del càncer o resposta a fàrmacs contra aquest i maximitzant el seu coeficient de cost/benefici.
