Adif ja ha adjudicat la redacció del projecte de la nova estació del TAV i del tren convencional que es farà a Vilafant i que es dirà, amb tota probabilitat, estació de l'Alt Empordà. S'ha encarregat la redacció del projecte però no s'ha decidit el lloc definitiu, ja que els ajuntaments de Figueres i Vilafant volen que sigui 300 metres més al sud d'on estava previst en l'estudi informatiu. En la redacció del projecte es preveu un aparcament amb capacitat per a 185 vehicles i 50 motos i bicicletes. L'edifici serà d'una planta i el vestíbul estarà situat a la cota del carrer –encara inexistent–. Hi haurà els serveis de venda de bitllets i informació, zona d'embarcament, lavabos, locals comercials i altres serveis vinculats amb l'explotació comercial de l'edifici, a més de les oficines tècniques. Hi haurà dues andanes per als trens d'alta velocitat de 400 metres de llargada i una, de 250 metres, per a la línia convencional Barcelona-Portbou. L'amplada de totes tres andanes serà de deu metres. També s'hi instal·laran marquesines. El projecte ha de definir si el pas per unir l'estació amb les andanes serà elevat o inferior. Es preveu que estigui redactat a mitjan 2009.

El govern municipal ha fet una valoració positiva de l'adjudicació perquè «dóna credibilitat al model ferroviari aprovat en el ple i desautoritza les veus que dubtaven de la posició que adoptaria l'administració estatal davant la construcció de la nova estació intermodal».