El director de l'aeroport de Girona preveu que amb cinc o sis anys s'hauran invertit a les instal·lacions de Vilobí d'Onyar uns 80 milions d'euros. Des del 2005, a l'aeroport s'ha remodelat la façana 1,4 milions, es va fer el primer edifici d'aparcaments prefabricat 4,4 milions; es van reorganitzar els aparcaments de davant de la terminal i es va fer una nova central elèctrica tres milions.
En aquests moments s'està construint el segon edifici prefabricat d'aparcament d'unes 350 places; han finalitzat les obres de les dues portes d'embarcament i les del dipòsit de 70.000 litres d'aigua de descàrrega ràpida per a la prevenció d'incendis, que està connectat amb el dipòsit d'aigua de l'aeroport de 700.000 litres, amb els quals «es podrà garantir que tots els camions contra incendis podran proveir-se tantes vegades com calgui».
També s'estan acabant les obres de la plataforma per als avions contra incendis de la Generalitat amb una superfície de 1.800 m² i que permet l'aprovisionament de tres aeronaus tipus AT-802F i que totes tres puguin proveir-se alhora; han entrat en funcionament les noves vies per a vianants de la pista d'aterratge, que han de garantir la seguretat dels passatgers que pugen o baixen dels avions i s'ha canviat de lloc l'equip de servei de terra, que fins ara era al davant mateix de la terminal.