Pedrerol va declarar que el pressupost previst pel 2009 a la regió sanitària de Girona «es mou en un context d'austeritat i de contenció, amb la voluntat de treballar amb eficiència en els serveis de salut». Segons Salut, el pressupost (693.621.891 euros) «garanteix un model de sistema sanitari que prioritza la qualitat tècnica i percebuda dels ciutadans, mantenint els nivells de resolució i prestacions actuals, ampliant prestacions (podologia i noves vacunes), prioritzant les que tenen finançament suplementari (l'atenció bucodental, per exemple) i impulsant projectes en àmbits com ara les tecnologies de la informació i la comunicació (TIC)», amb iniciatives tals com la recepta electrònica i la història clínica compartida. Les partides pressupostàries més importants es destinen a la contractació de serveis assistencials (307,7 milions); les receptes mèdiques (193,7 milions), i la medicació hospitalària (27 milions).
Salut invertirà 14,4 milions a infraestructures, tot i que el Departament no especifica la quantitat destinada a cada obra. En aquest sentit, destaca el projecte del nou edifici del Trueta, les obres del qual està previst que comencin el 2010. Amb l'objectiu d'«esponjar els edificis actuals», Pedrerol va explicar que de cares a l'any vinent es començaran a construir uns mòduls provisionals per a l'ampliació del servei de consultes externes del mateix hospital i de l'Institut Català d'Oncologia (ICO). A banda, continuaran les obres de reforma al Trueta per reubicar els dos hospitals de dia, ampliar l'àrea de reanimació postquirúrgica i guanyar espai per més llits d'hospitalització. També continuaran les obres d'ampliació i reforma dels hospitals de Figueres i Palamós. Quant a l'atenció primària, el 2009 està previst que s'enllesteixin els consultoris d'Aiguaviva, Amer, les Planes i Vilablareix, i el d'ampliació i reforma del consultori de Porqueres i del CAP Montilivi de Girona.
També començaran les obres del nou hospital comarcal de la Garrotxa i entraran en fase de licitació un nou CAP a Figueres i un a Sant Jordi Desvalls, i la substitució de les torres de refrigeració del CAP Güell de Girona. Pel que fa a les obres, que es preveu que estiguin acabades l'any que ve, hi ha la construcció del consultori de les Preses, d'un altre CAP a Lloret de Mar (al barri del Rieral) i del psicogeriàtric al Parc Hospitalari Martí i Julià de Salt. Així mateix, està previst que s'cabin les obres d'ampliació i reforma del CAP de Roses, a la zona d'urgències i de consultes.