En l'estudi elaborat per la consultoria d'enginyeria Intraesa es considera important fer una altra variant, en aquest cas per als trens de mercaderies que circulen per la línia Portbou-Barcelona, de manera que s'eviti que hagin de passar pel traçat urbà i es redueixin així els condicionants tècnics a l'hora de fer les vies subterrànies i els problemes ambientals i de seguretat. Es planteja que els trens de mercaderies es desviïn cap al centre de transport intermodal del Far si finalment es construeix i d'allà es perllongui uns quilòmetres la via, en paral·lel al cinturó de ronda, fins a enllaçar a la carretera de Llançà amb la via actual de Portbou.
TRAMVIA COMARCAL
Tots els grups municipals també van aprovar ahir en el ple demanar que Foment, Adif i la Generalitat es plantegin una connexió ferroviària, se suposa des de la línia actual, que enllaci Figueres, Castelló d'Empúries i Roses. Seria un tramvia comarcal que ja es preveu en el pla director de transports que ha elaborat la Generalitat per executar en les pròximes dècades. Aquest tramvia també justifica el manteniment de l'estació central on es ara.